Services web / Web services

  • CODA : Conserved Domain Architectures

Extension du projet DomainSieve à la recherche d'architectures conservées de domaines protéiques.
Extension of the DomainSieve project to the search for conserved architectures of protein domains.

Interface Web pour la recherche de domaines protéiques spécifiques à certains ensembles d'espèces bactériennes.
Web interface for searching protein domains specific to some bacteria species.

Base de données des élements transposables chez D. melanogaster avec une classification des familles d'éléments transposables.
Database of transposable elements in D. melanogaster, with a classification of transposable elements families.

« Multi-Scale Selector of Sequence » est une méthode de classification de séquences biologiques sans alignement. L'application web propose une évaluation de cette méthode pour des séquences biologiques de tailles modérées. Pour des séquences plus grandes une implémentation est disponible (contacter C. Devauchelle).
Multi-Scale Selector of Sequence Signatures is an alignment-free method for classification of biological sequences. This web application enables to evaluate the method on small data size only. For big data input an MS4 release is available (please contact C. Devauchelle).

Application web permettant l'exécution et la visualisation des résultats du programme de classification de sequences à l'aide de la méthode de N-Ecriture.
Web interface for executing and visualizing sequences classification based on N-Local Decoding.

  • SHIBA: Short Inversions in BActeria.

Application web pour l'exploration des résultats d'une recherche systématique de segments courts inversés dans les génomes bactériens.
Web interface for systematic search of short inverted segments in bacteria genomes.

Interface web pour l'exploitation de LHiSA.
Web interface for LHiSA.

Interface Web pour l'exploitation de SIC.
Web interface for SIC.

Interface Web pour l'exploitation de SPatt.
Web interface for SPatt.

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