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Camille Charbonnier (UEVE), Marine Jeanmougin (CNRS/Pharnext), Matthieu Bouaziz (CIFRE ANRT/Pharnext), Van Hanh Nguyen (UPS, Orsay), Justin Whalley (UEVE), Jonathan Plassais (CIFRE ANRT/TcLand), Marius Kwémou (IRD), Sarah Lemler (UEVE), Smahane Chalabi (UEVE).
2011
De l'art de résumer pour tenter de comprendre en génomique évolutive Devauchelle, C. Habilitation à diriger des recherches, Université d'Évry val d'Essonne   
De la nécessité de maîtriser les théories de l'évolution les plus récentes pour être en mesure de proposer des modèles vraisemblables d'évolution des architectures modulaires des protéines Brézellec, P. Habilitation à diriger des recherches, Université de Versailles Saint Quentin   
Etude structurelle des réseaux : modèles aléatoires, motifs et cycles Birmelé, E. Habilitation à diriger des recherches, Université d'Évry val d'Essonne   
2010
Approches modèles pour la structuration du Web vu comme un graphe Zanghi, H. Thèse de doctorat, Université d'Évry val d'Essonne   
Modèle d'évolution avec dépendance au contexte et Corrections de statistiques d'adéquation en présence de zéros aléatoires Finkler, A. Thèse de doctorat, Université de Strasbourg   
Modèles de graphes aléatoires à structure cachée pour l'analyse des réseaux Latouche, P. Thèse de doctorat, Université d'Évry val d'Essonne   
2008
Chaînes de Markov régulées et approximation de Poisson pour l'analyse de séquences biologiques Vergne, N. Thèse de doctorat, Université d'Évry val d'Essonne   
Parcimonie dans les modèles markoviens et applications à l'analyse des séquences biologiques Bourguignon, P.-Y. Thèse de doctorat, Université d'Évry val d'Essonne   
Statistique asymptotique dans des modèles à variables latentes Matias, C. Habilitation à diriger des recherches, Université d'Évry val d'Essonne   
2007
Analyse de processus stochastiques pour la génomique : étude du modèle MTD et inférence de réseaux bayésiens dynamiques. Lèbre, S. Thèse de doctorat, Université d'Évry val d'Essonne   
Méthodes statistiques pour l'analyse des données génétiques d'association à grande échelle Guedj, M. Thèse de doctorat, Université d'Évry val d'Essonne   
Outils et méthodes pour la classification pyramidale des données biologiques Vescovo, L. Thèse de doctorat, Université d'Évry val d'Essonne   
2006
Le domaine protéique, une unité d'homologie pertinente en génomique comparative Pasek, S. Thèse de doctorat, Université d'Évry val d'Essonne   
Le transcriptome : un nouveau domaine d'application pour les statistiques, de nouveaux horizons pour la biologie Carpentier, A.-S. Thèse de doctorat, Université d'Évry val d'Essonne   
PMC pour l'étude des occurrences de motifs dans les séquences markoviennes Nuel, G. Habilitation à diriger des recherches, Université d'Evry Val d'Essonne   
2005
Prédiction de la localisation cellulaire des protéines à l'aide de leurs séquences biologiques. Richard, H. Thèse de doctorat, Université d'Évry val d'Essonne   
2003
Mise au point et utilisation de modèles de chaînes de Markov cachées pour l'étude des séquences d'ADN Nicolas, P. Thèse de doctorat, Université d'Evry Val d'Essonne   
2001
Grandes déviations et chaînes de Markov pour l'étude des occurrences de mots dans les séquences biologiques Nuel, G. Thèse de doctorat, Université d'Evry Val d'Essonne   
1997
Comparaison d'algorithmes d'identification de chaînes de Markov cachées et application à la détection de régions homogènes dans les séquences d'ADN Muri, F. Thèse de doctorat, Université Paris V   
Anne-Laure Boulesteix (2011) Apprentissage statistique en grande dimension et données issues de la biologie moléculaire.
Sophie Schbath (2003) Deux approches mathématiques de l'analyse des génomes : statistiques des comptages de mots et prédictions en cartographie physique.
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